מפזר אולטרסאונדהיא להניח ישירות את תרחיף החלקיקים המיועד לטיפול בשדה האולטרסאונד ו"להקרין" אותו באמצעות אולטרסאונד בעוצמה גבוהה, שהיא שיטת פיזור אינטנסיבית ביותר. ראשית, התפשטות גל האולטרסאונד צריכה להשתמש במדיום כנשא. התפשטות גל האולטרסאונד במדיום כוללת תקופת לחץ חיובי ושלילי לסירוגין. המדיום נלחץ ונמשך תחת לחץ חיובי ושלילי של קולואיד.

כאשר גל קולי פועל על נוזל במדיום, המרחק בין מולקולות המדיום באזור הלחץ השלילי יעלה על המרחק המולקולרי הקריטי שבו המדיום הנוזלי נשאר ללא שינוי, והמדיום הנוזלי יישבר ויווצרו מיקרו-בועות, אשר יגדלו לבועות קוויטציה. בועות יכולות להתמוסס שוב בגז, או שהן יכולות לצוף ולהיעלם, או שהן עלולות לקרוס הרחק משלב התהודה של שדה הקולי. הופעה, קריסה או היעלמות של בועות קוויטציה במדיום נוזלי. קוויטציה תיצור טמפרטורה גבוהה מקומית ולחץ גבוה, ותיצור כוח פגיעה עצום ומיקרו-סילון. תחת פעולת הקוויטציה, פני השטח של אבקת הננו ייחלשו, כך שתתרחש פיזור של אבקת הננו.

להלן אמצעי הזהירות לשימוש במפזר קולי:

1. אין פעולה ללא עומס מותרת.

2. עומק המים של הצופר (גשש אולטרסאונד) הוא כ-1.5 ס"מ, ומפלס הנוזל טוב מ-30 מ"מ. הגשושית צריכה להיות באמצע ולא להידבק לקיר. גל אולטרסאונד הוא גל אורכי אנכי. לא קל ליצור הסעה כאשר הוא מוכנס עמוק מדי, מה שמשפיע על יעילות הריסוק.

3. הגדרת פרמטרים אולטרסאונד: הגדרת פרמטרי העבודה של המכשיר. עבור דגימות (כגון חיידקים) הרגישות לדרישות טמפרטורה, בדרך כלל משתמשים באמבט קרח בחוץ. הטמפרטורה בפועל חייבת להיות נמוכה מ-25 מעלות, וחומצת גרעין חלבון לא תתפרק.

4. בחירת מיכל: יש לבחור מספר כוסות כמספר הדגימות, דבר התורם גם להסעת הדגימות באולטרסאונד ומשפר את יעילות הריסוק. לדוגמה; כוס של 20 מ"ל עדיפה על כוס של 20 מ"ל. לדוגמה, פרמטרי הגדרת דגימת קוליפורם של 100 מ"ל: אולטרסאונד 5 שניות/מרווח של 5 שניות במשך 70 פעמים (הזמן הכולל הוא 10 דקות). ההספק הוא 300 וואט (לעיון בלבד), כ-500 מ"ל, וכ-500 וואט-800 וואט.